Whoopi Goldberg, de Academy Award winnende actrice, keert terug als de vurige cabaretzangeres Deloris van Cartier in dit swingende en dolkimsche vervolg op de succesfilm Sister Act. Dit keer hebben de zingende nonnen van St. Catherine's hun handen vol aan het runnen van een stadsschool vol lawaaiierige tieners. Hun gebeden worden beantwoord wanneer Deloris ermee akkoord gaat de school te infiltreren als de nieuwe muziekdocent. Ook ditmaal weet zuster Mary Clarence aan dogma te ontwijken en de godsdienst in de war te brengen. Zij probeert 'haar klas uit de hel' te bekeren tot een hemels klinkend hip-hop gospelkoor.