Het jaar is 2065 en de Aarde voert een slepende oorlog tegen een buitenaards ras dat de planeet wil veroveren. Het leger, met Generaal Hein (James Woods) op kop, wil een ultiem wapen inschakelen dat met succes de indringers zal vernietigen. De mooie en intelligente Dr. Aki Ross en mentor Sid (Donald Sutherland) denken daar echter anders over. De Aarde zal onherroepelijk beschadigd worden door het wapen. Aki en Sid zijn ervan overtuigd dat ze de Aarde kunnen redden van de buitenaardse wezens. En zo begint de strijd tegen de tijd, het geweld en de wetenschap...

Final Fantasy: The Spirits Within kent geen bestaande locaties, mensen of voertuigen. Dankzij speciaal ontwikkelde software en de allernieuwste ‘Computer Generated Image’-programmatuur zijn hyperrealistische menselijke acteurs tot stand gebracht. Kortom een totaal nieuwe en ongekende beleving van film.