In het nieuwe seizoen van De co- assistent valt Elin voor Arthur Godijn, een nachtportier met literaire ambities, terwijl haar moeder Geertje zich, tegen de zin van Elin, spontaan als vrijwilligster bij de patiëntenbegeleiding van het ziekenhuis aanmeldt. Voor de andere twee co- assistenten Hugo Biesterveld en Marjolein van der Bijl gaan privé en werk ook behoorlijk door elkaar lopen, wat de opleiding er niet makkelijker op maakt. Hugo’s broertje Maurits wordt ernstig ziek in het ziekenhuis opgenomen en Marjolein kan haar gevoelens voor dokter Verstraeten niet meer onderdrukken.

Dan zijn er nog twee verse co- assistenten, Aaltje van Dongen en Mo EL Amrani, die diep door het stof moeten voor de artsen. Beide blijken onvermoede kanten te hebben. Arts- assistent Thomas van Loon heeft het zwaar met het verwerken van het verlies van zijn vrouw en ten slotte gaat radiologe Sabine Lacroix, na een ongemakkelijke relatie met Hugo, weer terug naar haar man.