Mystery Inc. heeft het grootste mysterie van allemaal opgelost! Scooby-Doo en zijn vrienden hebben Coco Diablo te pakken gekregen, het beruchte meesterbrein achter elk kostuum waarmee ze ooit de strijd hebben aangebonden, zoals de Black Knight, Space Kook en Ghost Driver. Kunnen de speurneuzen lekker ontspannen nu Coco en haar kat veilig achter de tralies zitten? Dat had je gedacht! Dreigende dubbelgangers en oude vijanden duiken op in Coolsville en proberen Halloween te ruïneren, dus aan de ondernemende kinderen en hun onvoorspelbare nieuwe bondgenoot de taak om een nieuwe schurk te ontmaskeren. Met trick-or-treat op het spel, nemen Scooby en Shaggy het hoogst persoonlijk op.